Chùa Từ Vân còn được gọi là chùa Ốc là do đặc điểm của chùa có một số công trình tôn giáo, nơi đặt tượng thờ Quán Thế Âm Bồ Tát, tháp Đa bảo, hang động nằm dưới mặt đất… được xây từ san hô và trang trí bằng vỏ ốc, vỏ sò. Hòa thượng trụ trì Thích Anh Tông cho biết, từ năm 1985 đến 1995, khi Nhà nước Việt Nam chưa có lệnh cấm khai thác đá san hô nên chùa đã thu nhặt đá san hô ở bãi biển Cam Bình về xây dựng. Hơn nữa, theo kinh Phật thuyết Adi đà thì san hô là vật liệu quý của biển nên các tín đồ muốn sử dụng để xây chùa tháp. Đặc sắc nhất là Bảo tháp cao gần 40m, được xây dựng từ hàng vạn tảng san hô và hàng triệu vỏ sò, vỏ ốc. Tháp hình chóp nhọn, chia thành ba tầng nhô lên cao. Bức tường chịu lực với phần cốt hoàn toàn bằng đá san hô. Lòng tháp hình tròn mở ra 8 cửa, tượng trưng cho Bát Chánh Đạo. Trong tháp có hai tầng, tầng trên thờ Phật, tầng dưới cho khách thăm viếng. Bên ngoài Bảo tháp là 49 tiểu tháp cũng có hình chóp. Trên đỉnh mỗi tiểu tháp lại có một bảo tháp nhỏ. Mặt ngoài Bảo tháp nổi lên từng thớ san hô được đẽo gọt đều nhau.